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GraficoはRaphaëlと Prototype.jsの2つのライブラリを使用してつられたチャート作成ライブラリです。
MooToolsを使用してバブルチャートが作成できるライブラリmoochart というものを見つけたのでご紹介。
色やサイズ、線の色、tooltipの設定ができるようです。 サイトにデモがありますのでぜひ見てみてください。